Depois de seu lançamento em 2008, na Alemanha, a Yamaha fez o primeiro faceliftna XJ6 (no Brasil como XJ6 N). O modelo 2013 apresenta novas modificações visuais em relação ao modelo anterior.
Entre as novas alterações no visual, estão: nova carenagem do farol dianteiro, do tanque, piscas transparentes (antes amarelados), a alça do garupa também foi modificada, painel com luz de LED, novo material no assento, pintura do motor e do para-lama dianteiro modificadas.
O motor continua o mesmo: Um quatro cilindros de 600 cm³, refrigeração à água, injeção eletrônica, 77,5 cv à 10.000 rpm e 6,09 kgfm de torque à 8.500 rpm.
O modelo antigo ainda continua sendo vendido no Brasil por R$ 27.850, sem previsão do novo modelo entrar no mercado Nacional.